ويخزن الثوم فى مخازن عادية ذات فتحات تهوية من اسفل ومن اعلى مع ضرورة وضع سلك على الفتحات – وذلك لمدة 3 – 4 شهور تزيد هذه المدة اذا كانت المخازن جافة جيدة التهوية – حيث توضع الرؤوس فى اجولة شبكية ترص فوق بعضها – ويفضل وضع هذه الاجولة على طبالى من الخشب – ويراعى الا يتجاوز ارتفاع الاجولة فوق بعضها عن 1.5 متر – مع ضرورة تغيير وضع الاجولة بين الحين والاخر – كما يفضل ترك فراغات بين الرصات بعضها البعض حوالى 50 سم حيث تسمح بتهوية جيدة وكذلك لمرور العمال بحرية وحركة دون اعاقة ويفضل ان تعبأ الرؤوس فى صناديق بلاستيكية ذات ابعاد 60 × 40 × 18 سم ترص فوق بعضها داخل المخازن – حيث تسمح تلك الصناديق بتهوية جيدة للعبوات – وتسمح بعدد رصات ( ارتفاعات ) اكبر 

وتزيد نسبة تفريغ الفصوص بالتخزين فى المخازن العادية , ويقل الفقد فى الوزن الحادث اثناء التخزين . كما تقل سرعة التزريع للثوم عندما تخزن الرؤوس فى الثلاجات على درجة حرارة الصفر المئوى – ورطوبة نسبية من 65 – 70 % وذلك لمدة من 6 – 7 شهور 
هذا ويحدث تزريع سريع للفصوص اذا خزنت الرؤوس على درجة حرارة من 4 – 18 ⁵ مئوية 
كما يجب الا تزيد الرطوبة الجوية النسبية فى المخازن المبردة – حيث ان زيادتها تسبب زيادة فى نسبة الاصابة باعفان الرؤوس – كما تزيد من نمو الجذور . مع مراعاة الا تقل الرطوبة الجوية عن هذا المدى 65 – 70 % حتى نتجنب ظاهرة تفريغ الفصوص